More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3333 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  99.04 
 
 		 311 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  93.29 
 
 		 298 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.26 
 
 		 403 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.7 
 
 		 295 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.36 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.36 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.36 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.36 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.36 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  88.36 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  87.85 
 
 		 295 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  86.73 
 
 		 295 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  87.15 
 
 		 295 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  87.15 
 
 		 295 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  87.15 
 
 		 295 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  86.81 
 
 		 295 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  86.81 
 
 		 295 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  76.95 
 
 		 309 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  78.93 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  77.3 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  73.17 
 
 		 295 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  71.78 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  64.64 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  64.21 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  61.4 
 
 		 279 aa  342  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  61.05 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  59.19 
 
 		 284 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  60.61 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  59.93 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  54.51 
 
 		 289 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  53.28 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  54.44 
 
 		 279 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  54.07 
 
 		 279 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  53.79 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  53.79 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  53.79 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  53.68 
 
 		 279 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  52.83 
 
 		 279 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  53.79 
 
 		 279 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  54.14 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  53.76 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  53.16 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  51.41 
 
 		 281 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  50.71 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3833  CBS domain-containing protein  50.36 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  50.56 
 
 		 284 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  46.86 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  48.41 
 
 		 283 aa  265  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  49.81 
 
 		 279 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.95 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  48.95 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  49.25 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  48.33 
 
 		 291 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  52.03 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  49.44 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  50.75 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  48.13 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.96 
 
 		 292 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3698  CBS  48.71 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  47.96 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  50.36 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3385  transport protein  47.78 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.428811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  47.92 
 
 		 285 aa  255  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  45.42 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  49.08 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  43.37 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  46.79 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  45.9 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  46.67 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  45.85 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.47 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  45.36 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  45.49 
 
 		 291 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  45.49 
 
 		 291 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  45.45 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  45 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 323 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  46.27 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  46.37 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  44 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  45.29 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  44.93 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  44.93 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  44.93 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  44.93 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  45.77 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  48.7 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  48.7 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  46.89 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  47.55 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  46.5 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3575  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.16 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  46.04 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  47.6 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2912  CBS domain-containing protein  45.32 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1216  transporter-associated region  45.96 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.14368  normal  0.614507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3303  hypothetical protein  47.16 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  44.91 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1833  magnesium and cobalt efflux protein CorC  45.11 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>