113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3560 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  100 
 
 		 173 aa  353  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  64.63 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  64.2 
 
 		 181 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  68.45 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  60.12 
 
 		 186 aa  202  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  61.05 
 
 		 192 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  59.51 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  59.51 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  59.3 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  59.06 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  61.11 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  56.63 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  58.24 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  59.17 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5214  ChaC family protein  58.14 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.608281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  56.02 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  55.76 
 
 		 176 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  57.4 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2547  ChaC family protein  58.64 
 
 		 189 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  55.69 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  52.69 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  45.88 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0017  ChaC family protein  52.63 
 
 		 212 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.189731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  47.13 
 
 		 192 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  46.15 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  45.45 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  44.31 
 
 		 175 aa  138  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2287  ChaC-like protein  42.26 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0627  putative ChaC-like protein  45.78 
 
 		 237 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0963  ChaC family protein  41.67 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0409  ChaC family protein  44.91 
 
 		 219 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3332  ChaC family protein  45.18 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1038  ChaC-like protein  44.71 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  43.68 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0729  ChaC family protein  44.44 
 
 		 249 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740634  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0799  ChaC family protein  43.83 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.444522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6024  ChaC-like protein  44.24 
 
 		 210 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0602  ChaC family protein  44.85 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2084  ChaC-like protein  43.64 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2749  ChaC family protein  44.24 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0164562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2696  ChaC family protein  43.64 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0640331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2724  ChaC family protein  43.64 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2613  ChaC family protein  44.24 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.303262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0588  ChaC-related protein  43.98 
 
 		 210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0222  ChaC-related protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0886  hypothetical protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2724  ChaC family protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2354  ChaC family protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0705  ChaC family protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0720  ChaC family protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2434  ChaC family protein  43.98 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3553  ChaC-like protein  43.2 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  42.5 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2988  ChaC family protein  42.11 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.132092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  42.5 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  42.5 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1879  ChaC family protein  41.21 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  42.07 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2056  ChaC family protein  40.61 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.013556  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0782  hypothetical protein  42.07 
 
 		 248 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  42.07 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3941  ChaC family protein  38.32 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  normal  0.174216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2801  ChaC family protein  42.17 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2926  uncharacterized protein involved in cation transport  41.21 
 
 		 218 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.426229  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5351  ChaC family protein  42.86 
 
 		 236 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  41.25 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2633  ChaC-like protein  39.76 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0613681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2920  ChaC family protein  42.17 
 
 		 242 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.508921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0825  ChaC-like protein  39.76 
 
 		 280 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0341641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  40.85 
 
 		 222 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  40.37 
 
 		 252 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6012  ChaC family protein  40.12 
 
 		 245 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  40.72 
 
 		 258 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5704  ChaC family protein  34.5 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3710  ChaC family protein  40.51 
 
 		 242 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4923  ChaC-like protein  40.12 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2330  ChaC family protein  34.91 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5792  ChaC family protein  38.27 
 
 		 263 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000625495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2428  ChaC family protein  33.74 
 
 		 238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.216984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1368  chaC protein  33.54 
 
 		 238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0977707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1922  chaC protein  33.74 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522557  normal  0.0428933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1701  chaC protein  34.59 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1326  chaC protein  32.93 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  34.91 
 
 		 246 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2405  ChaC family protein  32.93 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1385  chaC protein  32.93 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  38.27 
 
 		 231 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  37.42 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01196  regulatory protein for cation transport  31.9 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01206  hypothetical protein  31.9 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  35.37 
 
 		 231 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  35.62 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  32.34 
 
 		 224 aa  99  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2888  ChaC-like protein  32.14 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2571  ChaC family protein  33.8 
 
 		 228 aa  94.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2265  ChaC family protein  33.8 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1758  ChaC family protein  33.79 
 
 		 226 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0056  ChaC family protein  35.15 
 
 		 247 aa  91.3  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.857973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1214  ChaC family protein  34.94 
 
 		 236 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296415  normal  0.688682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4148  ChaC family protein  32.12 
 
 		 262 aa  87.8  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>