More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1893 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  59.24 
 
 
831 aa  961  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  3.84079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  100 
 
 
807 aa  1657  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  1.00629e-08  unclonable  8.08467e-11 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  58.81 
 
 
821 aa  970  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  2.37623e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  36.95 
 
 
865 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  82.76 
 
 
460 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  82.76 
 
 
460 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  82.76 
 
 
460 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  82.76 
 
 
460 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  82.41 
 
 
460 aa  462  1e-128  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  99.57 
 
 
460 aa  460  1e-128  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  98.72 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  35.37 
 
 
782 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  35.37 
 
 
782 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  34.33 
 
 
863 aa  447  1e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  34.68 
 
 
824 aa  446  1e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  95.71 
 
 
462 aa  446  1e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  94.44 
 
 
461 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  94.44 
 
 
461 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  33.3 
 
 
871 aa  441  1e-122  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  35.99 
 
 
772 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  36.06 
 
 
1118 aa  422  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  32.98 
 
 
832 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  85.78 
 
 
462 aa  402  1e-110  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  85.78 
 
 
462 aa  402  1e-110  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  85.84 
 
 
473 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  84.91 
 
 
463 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  33.21 
 
 
749 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  76.32 
 
 
463 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  67.03 
 
 
462 aa  363  7e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  56.68 
 
 
463 aa  358  2e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  68.3 
 
 
470 aa  351  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  73.45 
 
 
465 aa  351  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  68.46 
 
 
461 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  63.53 
 
 
470 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.53139e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  63.85 
 
 
461 aa  339  1e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  62.84 
 
 
460 aa  330  5e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  62.84 
 
 
460 aa  330  5e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  64.42 
 
 
472 aa  326  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  60.15 
 
 
462 aa  324  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  70.51 
 
 
479 aa  317  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  59.33 
 
 
472 aa  315  2e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  65.79 
 
 
473 aa  312  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  65.22 
 
 
468 aa  312  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.29174e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  65.35 
 
 
465 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.80092e-06 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  67.11 
 
 
468 aa  311  3e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  61.13 
 
 
473 aa  310  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  64.32 
 
 
465 aa  309  1e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  64.35 
 
 
468 aa  309  1e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.91308e-06  hitchhiker  8.17807e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  64.35 
 
 
468 aa  309  1e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  64.35 
 
 
468 aa  309  1e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.59812e-08  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  64.32 
 
 
465 aa  309  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  64.32 
 
 
465 aa  309  1e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  64.35 
 
 
468 aa  309  1e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.2144e-05  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  67.08 
 
 
471 aa  309  1e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  60.87 
 
 
469 aa  308  2e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  65.35 
 
 
472 aa  308  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  56.72 
 
 
464 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  57.09 
 
 
465 aa  308  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  56.83 
 
 
464 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  56.83 
 
 
464 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  57.09 
 
 
457 aa  306  8e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  57.09 
 
 
457 aa  306  8e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  63.91 
 
 
468 aa  306  1e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.07977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  63.91 
 
 
468 aa  306  1e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.04004e-06  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  63.91 
 
 
468 aa  306  1e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.32195e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  63.91 
 
 
468 aa  306  1e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  3.88708e-12 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  64.04 
 
 
468 aa  305  2e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.57541e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  63.6 
 
 
466 aa  305  2e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.92135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  56.13 
 
 
463 aa  305  3e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  56.34 
 
 
464 aa  305  3e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  63.04 
 
 
468 aa  304  4e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.42812e-07  unclonable  2.95185e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  63.04 
 
 
468 aa  304  4e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.1661e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  63.48 
 
 
468 aa  304  5e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  63.04 
 
 
468 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.37695e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  62.61 
 
 
468 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.11425e-05  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  61.83 
 
 
473 aa  301  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  58.89 
 
 
464 aa  301  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  56.07 
 
 
471 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  56.07 
 
 
471 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  61.84 
 
 
465 aa  301  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  59.92 
 
 
458 aa  300  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  63.91 
 
 
469 aa  299  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  57.63 
 
 
469 aa  297  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  62.61 
 
 
468 aa  298  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.07576e-05  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  55.34 
 
 
478 aa  296  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.86038e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  64.04 
 
 
472 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  69.91 
 
 
473 aa  295  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  63.32 
 
 
477 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  64.04 
 
 
472 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  56.06 
 
 
470 aa  293  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  59.23 
 
 
472 aa  293  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  54.64 
 
 
476 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  62.17 
 
 
468 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>