63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2660 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  98.94 
 
 		 94 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  93.62 
 
 		 94 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  92.55 
 
 		 94 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  92.47 
 
 		 94 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  65.59 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  61.96 
 
 		 94 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  60.87 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  60.87 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  43.68 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  44.68 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  39.33 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  46.24 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  39.08 
 
 		 615 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  39.33 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  40.86 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  44.26 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  39.78 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  37.89 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  38.3 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  37.89 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  38.3 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  34.48 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  35.96 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  38.3 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  37.89 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  37.89 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  38.3 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  39.13 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  37.08 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  37.14 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  37.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  39.36 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  37.33 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  34.94 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  32.95 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  40.86 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  40.26 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  37.31 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  40.86 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  36.56 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  34.04 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  35.06 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>