39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1321 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 
423 aa  862  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  1.80036e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  100 
 
 
423 aa  862  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  2.81443e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  26.92 
 
 
340 aa  112  2e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  25.52 
 
 
353 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  26.09 
 
 
381 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  25.87 
 
 
350 aa  71.6  3e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  5.76608e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  23.6 
 
 
341 aa  68.2  2e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  25.95 
 
 
736 aa  50.4  6e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  28.32 
 
 
290 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  27.7 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  25.48 
 
 
215 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  31.36 
 
 
204 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.91421e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  25.66 
 
 
212 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  25 
 
 
212 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2868  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.03 
 
 
719 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706713  normal  0.0333863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  27.39 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  23.08 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  7.3544e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  23.08 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.18611e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  24.34 
 
 
212 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0946  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.66 
 
 
745 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  25 
 
 
210 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  28.35 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1576  GTP pyrophosphokinase  27.81 
 
 
746 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  27.4 
 
 
744 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  28.12 
 
 
216 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  27.4 
 
 
745 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  4.88354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.47 
 
 
746 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.47 
 
 
746 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11397  hypothetical protein  26.62 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  30.15 
 
 
198 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  25.73 
 
 
745 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  27.27 
 
 
267 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.63425e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>