69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1931 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
382 aa  738    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.42 
 
 
409 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.03 
 
 
393 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  52.96 
 
 
393 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  45.66 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  46.2 
 
 
377 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  46.03 
 
 
385 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.82 
 
 
391 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.44 
 
 
419 aa  249  7e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.39 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1414  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.06 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  42.94 
 
 
371 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  44.39 
 
 
379 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40 
 
 
416 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.25 
 
 
412 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.18 
 
 
389 aa  239  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.74 
 
 
372 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.07 
 
 
372 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.13 
 
 
412 aa  230  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  42.19 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.03 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.32 
 
 
412 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.36 
 
 
414 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2694  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.42 
 
 
378 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2738  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.42 
 
 
378 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310844  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.64 
 
 
377 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.14 
 
 
378 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243373  normal  0.467726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.04 
 
 
377 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  40.1 
 
 
393 aa  206  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.94 
 
 
391 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.82 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  37.72 
 
 
419 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  37.2 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.43 
 
 
397 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  32.67 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1198  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.83 
 
 
374 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.84 
 
 
412 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.63 
 
 
470 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.72 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  25.51 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.46 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.51 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.48 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.08 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.37 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.43 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  28.93 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.48 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.48 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.899257  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.81 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.17 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  23.65 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  29.66 
 
 
428 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  27.17 
 
 
433 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  27.17 
 
 
433 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2797  hypothetical protein  23.58 
 
 
274 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383004  hitchhiker  0.0000926251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  22.82 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.47 
 
 
262 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  22.11 
 
 
435 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.07 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  26.64 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0333  metalloenzyme domain protein  25.5 
 
 
515 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134718  normal  0.059537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  25.53 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  26.26 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  23.08 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  30.66 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.91 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.91 
 
 
478 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  28.06 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>