More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0168 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  100 
 
 
125 aa  246  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  100 
 
 
125 aa  246  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  93.6 
 
 
125 aa  231  2e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  93.6 
 
 
125 aa  231  2e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  93.6 
 
 
125 aa  231  2e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  92.8 
 
 
125 aa  230  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  87.2 
 
 
125 aa  215  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  73.68 
 
 
126 aa  170  7e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  71.93 
 
 
126 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  65.83 
 
 
120 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.59905e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  63.64 
 
 
125 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  63.64 
 
 
125 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  55.17 
 
 
121 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  51.69 
 
 
120 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
120 aa  127  5e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  53.45 
 
 
121 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  51.3 
 
 
121 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  51.3 
 
 
121 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  46.22 
 
 
121 aa  118  2e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  48.7 
 
 
121 aa  119  2e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  50.85 
 
 
120 aa  117  5e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  46.22 
 
 
121 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
121 aa  116  1e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
121 aa  116  1e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
121 aa  116  1e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
121 aa  116  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
121 aa  115  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
121 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
121 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  50.44 
 
 
120 aa  114  4e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  51.79 
 
 
120 aa  113  7e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  46.61 
 
 
123 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  46.61 
 
 
120 aa  112  2e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
120 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  48.7 
 
 
120 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
120 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
120 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  48.67 
 
 
120 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
121 aa  108  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  48 
 
 
137 aa  107  4e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  48 
 
 
137 aa  107  4e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  49.14 
 
 
123 aa  106  9e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  49.11 
 
 
120 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
121 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  47.32 
 
 
120 aa  105  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  45 
 
 
121 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  48.21 
 
 
120 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  45.38 
 
 
121 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  47.83 
 
 
121 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  42.5 
 
 
121 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  48.21 
 
 
120 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
121 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  49.11 
 
 
120 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
121 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
121 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 
128 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  48.28 
 
 
122 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  46.9 
 
 
121 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  48.28 
 
 
122 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  44.25 
 
 
121 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
122 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  50.44 
 
 
124 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  46.85 
 
 
122 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  45.79 
 
 
121 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  47.2 
 
 
137 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
122 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  45.79 
 
 
121 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  45.79 
 
 
121 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  50.44 
 
 
126 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
122 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  43.33 
 
 
122 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  49.09 
 
 
122 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  48.18 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  42.86 
 
 
121 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  49.09 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  42.2 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
124 aa  97.1  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  45.28 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  47.12 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  45 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  50 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  45.54 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  47.37 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  43.12 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
121 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>