32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0415 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  58.11 
 
 		 753 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  90.45 
 
 		 764 aa  1460    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1579    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  58.11 
 
 		 753 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  33.78 
 
 		 670 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  22.46 
 
 		 800 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  30.59 
 
 		 539 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  31.34 
 
 		 462 aa  88.2  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  32.08 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  33.52 
 
 		 791 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  33.71 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  28.79 
 
 		 769 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  28.79 
 
 		 802 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  28.79 
 
 		 769 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  28.36 
 
 		 802 aa  77  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  36.25 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  30.43 
 
 		 815 aa  73.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  30.08 
 
 		 740 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  22.86 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  26.07 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  29.56 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  30.1 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  30.1 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  30.1 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  26.84 
 
 		 802 aa  67.4  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  27.35 
 
 		 882 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2918  hypothetical protein  42.11 
 
 		 568 aa  54.7  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  26.39 
 
 		 686 aa  50.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  26.53 
 
 		 777 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  24.61 
 
 		 494 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  25.13 
 
 		 522 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>