295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0907 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  100 
 
 
349 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  47.89 
 
 
326 aa  239  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  46.06 
 
 
322 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  46.73 
 
 
317 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  48.8 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  44.94 
 
 
316 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  43.26 
 
 
330 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  48.06 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  44.05 
 
 
318 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  47.45 
 
 
328 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  47.45 
 
 
328 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  42.94 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  43.23 
 
 
318 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  46.55 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  45.95 
 
 
318 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  43.03 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  38.58 
 
 
325 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  39.35 
 
 
313 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  36.86 
 
 
324 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  44.02 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  40.42 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  39.22 
 
 
315 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  38.92 
 
 
315 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 
313 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  36.25 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  36.98 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  38.28 
 
 
308 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.67 
 
 
310 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  37.57 
 
 
313 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  42.6 
 
 
321 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.42 
 
 
312 aa  159  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.95 
 
 
311 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  38.64 
 
 
314 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  38.64 
 
 
315 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  36.09 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
315 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  36.09 
 
 
312 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  36.31 
 
 
310 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  37.57 
 
 
313 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.12 
 
 
306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  29.31 
 
 
310 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  29.61 
 
 
310 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.56 
 
 
308 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  40.62 
 
 
322 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  39.26 
 
 
333 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.42 
 
 
314 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  38.61 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 
324 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  29.61 
 
 
310 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  33.56 
 
 
311 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  37.66 
 
 
325 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  28.61 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30.67 
 
 
303 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.21 
 
 
303 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  28.4 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.12 
 
 
314 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  28.14 
 
 
307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  38.75 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.76 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  39.93 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  29.76 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  29.76 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  29.76 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.69 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.29 
 
 
304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  30.63 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  40.73 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  30.31 
 
 
300 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
306 aa  126  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  36.84 
 
 
325 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  38.93 
 
 
325 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  37.85 
 
 
316 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.38 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  29.67 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>