57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1427 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  99.56 
 
 
229 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  99.56 
 
 
229 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  96.07 
 
 
229 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 
229 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
234 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  36.86 
 
 
230 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  33.47 
 
 
236 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.86 
 
 
236 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  35.02 
 
 
236 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  34.33 
 
 
238 aa  120  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
232 aa  120  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
236 aa  119  4e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  28.63 
 
 
244 aa  119  5e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  33.05 
 
 
236 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 
235 aa  118  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
244 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 
223 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
236 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
250 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
224 aa  110  2e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 
236 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
224 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
236 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
236 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
224 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
223 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
223 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 
288 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
234 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
222 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
222 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 
227 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  34.19 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
236 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
225 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 
224 aa  80.5  2e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  27.9 
 
 
271 aa  80.1  3e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  32.19 
 
 
211 aa  79  6e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.06 
 
 
222 aa  73.6  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
218 aa  68.9  7e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 
231 aa  53.9  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>