More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1617 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  85.19 
 
 		 83 aa  144  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  78.05 
 
 		 84 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  76.54 
 
 		 85 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  75.31 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 84 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  120  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  82.61 
 
 		 91 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 87 aa  117  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  70.37 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  76.39 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  76.39 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  67.86 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3859  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.598699  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  79.71 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  67.86 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  70.83 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  67.9 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  65 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>