More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0885 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  58.78 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  56.91 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  54.47 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  50.76 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  47.26 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  46.97 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  47.58 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  52.03 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  51.59 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  47.73 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  50.41 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  48.84 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  50.82 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  48.44 
 
 		 187 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  52 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  47.15 
 
 		 123 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  48.78 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  48.8 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  52.03 
 
 		 131 aa  121  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  52.5 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  48.78 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  47.2 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  47.76 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  49.59 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  48.78 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  49.59 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  49.19 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  49.19 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  49.19 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  50.41 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  49.6 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  45.67 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  42.4 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  36.8 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36.29 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  40.17 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  39.52 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  40.17 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.35 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  40.52 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  41.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  41.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  41.59 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  41.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  41.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  39.82 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  37.5 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  36.36 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  37.9 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  37.9 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  40.32 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  37.9 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  39.66 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  38.94 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  38.94 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  40.78 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  38.52 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  30.23 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  39.84 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  36.29 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  38.94 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.01 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.01 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  41.75 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  36.59 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  37.9 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>