More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0226 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
288 aa  593  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
288 aa  593  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
288 aa  593  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  99.65 
 
 
288 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  99.31 
 
 
288 aa  591  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  99.31 
 
 
288 aa  591  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  99.31 
 
 
288 aa  590  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  98.61 
 
 
288 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  98.61 
 
 
288 aa  587  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  97.22 
 
 
288 aa  577  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
314 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
294 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
295 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  40.71 
 
 
283 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
287 aa  220  2e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
283 aa  218  9e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
283 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  38.16 
 
 
292 aa  214  1e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.20497e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  39.3 
 
 
312 aa  213  3e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
283 aa  212  5e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  39.65 
 
 
283 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
283 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  38.03 
 
 
285 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
283 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
296 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 
287 aa  173  2e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
296 aa  171  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  32.74 
 
 
286 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  6.64485e-08 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
292 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 
290 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
301 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  36.48 
 
 
288 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2472  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.09 
 
 
289 aa  162  8e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2570  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
289 aa  162  8e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3012  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  33.09 
 
 
289 aa  162  8e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.450438  hitchhiker  0.000703378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
305 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2562  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
288 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3152  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
288 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  35.29 
 
 
298 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2703  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
289 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.664835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 
304 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
305 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2893  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
288 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0897253  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2310  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 
287 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
305 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 
292 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
293 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
293 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
293 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 
292 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 
293 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  30.18 
 
 
293 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 
293 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.18 
 
 
293 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
293 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
292 aa  155  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  30.28 
 
 
290 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.07 
 
 
291 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  30.28 
 
 
290 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  30.28 
 
 
290 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  30.28 
 
 
290 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  30.28 
 
 
290 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3275  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
295 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 
293 aa  153  3e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
297 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
304 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
297 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
297 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
305 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  34.42 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
337 aa  148  1e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  34.42 
 
 
341 aa  148  1e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
341 aa  148  1e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
297 aa  148  1e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
341 aa  148  1e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0281  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
307 aa  147  1e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
290 aa  148  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
341 aa  148  1e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
297 aa  147  2e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
304 aa  146  4e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 
290 aa  145  7e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
309 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
321 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1398  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
295 aa  141  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
295 aa  140  2e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
304 aa  139  5e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 
293 aa  138  9e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.62954e-09  decreased coverage  9.99677e-08 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 
302 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 
302 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 
305 aa  135  6e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
291 aa  135  6e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  30.82 
 
 
302 aa  135  6e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.540321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>