67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3503 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  73.53 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  61.17 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  59.22 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  50.49 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  51.46 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  50.49 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  52.43 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  53.4 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.12 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.66 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  47.12 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  47.12 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  47.12 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  47.12 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.18 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.18 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.25 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.95 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.27 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  36.27 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.22 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.27 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  32.71 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.77 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.31 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.98 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.95 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.27 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.24 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.47 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.74 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.38 
 
 		 124 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  29.41 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  34.52 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.31 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.84 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  31 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.78 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.31 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.81 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.84 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  28.04 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.58 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2505  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.52 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  27.45 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.85 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  25.49 
 
 		 103 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  37.89 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.49 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.63 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.16 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  25.49 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.01 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.49 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>