175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0114 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  100 
 
 
174 aa  358  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  65.5 
 
 
172 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  65.5 
 
 
172 aa  230  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  62.5 
 
 
173 aa  224  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  55.88 
 
 
177 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  53.25 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  52.66 
 
 
182 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  52.35 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
176 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
176 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  50.3 
 
 
182 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  52.69 
 
 
183 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  52.38 
 
 
175 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  51.48 
 
 
175 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  51.48 
 
 
175 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  51.48 
 
 
175 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  51.48 
 
 
175 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  51.48 
 
 
175 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  51.48 
 
 
426 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  53.29 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  50.89 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
176 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
176 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
176 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  54.55 
 
 
179 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
176 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  52.41 
 
 
173 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
175 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
178 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  42.17 
 
 
170 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  43.27 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  43.45 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  41.76 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
173 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  42.21 
 
 
177 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
182 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  40.36 
 
 
177 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  39.18 
 
 
175 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  36.36 
 
 
167 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 
196 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  34.62 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  37.95 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  34.87 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  34.39 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  31.36 
 
 
167 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  32.48 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  31.85 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  31.85 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  31.85 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
183 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  35.47 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  36.09 
 
 
181 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  31.55 
 
 
176 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
153 aa  95.9  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8033  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  28.67 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  25.52 
 
 
201 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
193 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
381 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
158 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6158  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0997895  normal  0.166229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.17 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  36.62 
 
 
83 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
196 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
162 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  34.48 
 
 
146 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2771  acetyltransferase, GNAT family  30.17 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 
152 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  31.25 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3024  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8064  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.84 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  25 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  32.47 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0832714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
188 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
128 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
171 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0702354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  34.41 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.32 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>