60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0175 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  100 
 
 		 56 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  94.64 
 
 		 56 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  76.36 
 
 		 58 aa  95.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  76.36 
 
 		 58 aa  95.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  78.18 
 
 		 59 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  73.21 
 
 		 56 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  75 
 
 		 54 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  52.73 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  46.94 
 
 		 50 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  44.9 
 
 		 50 aa  57  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  44.9 
 
 		 50 aa  57  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48.84 
 
 		 58 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  44.9 
 
 		 50 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  45.1 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  41.67 
 
 		 50 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  41.67 
 
 		 50 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  41.67 
 
 		 50 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  46.94 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  39.58 
 
 		 50 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  43.1 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  43.64 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  42.55 
 
 		 50 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  48.84 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  48.84 
 
 		 47 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  48.84 
 
 		 47 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  51.16 
 
 		 47 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  48.84 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  42.86 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  51.28 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  46.51 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  51.16 
 
 		 47 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48.84 
 
 		 47 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  42.86 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  57.5 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  48.84 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  43.9 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  47.62 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  43.18 
 
 		 45 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  42.5 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  42.86 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  45.24 
 
 		 48 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  43.14 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  45.24 
 
 		 48 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  45.28 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  44.19 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  46.51 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  40.82 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17411  high light inducible protein  53.85 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  45.24 
 
 		 48 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13681  high light inducible protein  62.07 
 
 		 86 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  43.64 
 
 		 48 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0886  high light inducible protein  53.85 
 
 		 97 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  65.38 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  65.38 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  44.19 
 
 		 46 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  48.84 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  37.04 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  42.22 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15161  high light inducible protein  61.54 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>