More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1367 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 78 aa  164  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  62.86 
 
 		 70 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  57.97 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  54.29 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  61.76 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  59.42 
 
 		 81 aa  93.6  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 		 75 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  56.52 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  55.07 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.34 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  55.07 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  59.09 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  56.52 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  57.97 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  56.76 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  57.97 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  57.58 
 
 		 206 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  59.09 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  54.93 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  50.67 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  56.06 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  55.38 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.52 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  55.41 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.71 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  57.35 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  57.35 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.07 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  56.52 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.07 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  60 
 
 		 88 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  58.57 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  53.62 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  55.56 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  52.05 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  53.62 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  51.25 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  54.29 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  51.35 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  57.97 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  64.41 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  48.53 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2761  protein of unknown function DUF37  56.76 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000958136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  54.55 
 
 		 72 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  52.86 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  57.58 
 
 		 84 aa  84.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 72 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  49.32 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.45 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  52.17 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  60.66 
 
 		 86 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>