27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4237 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  71.04 
 
 		 334 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  67.1 
 
 		 333 aa  300  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  65.35 
 
 		 338 aa  292  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  70.3 
 
 		 380 aa  291  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  74.48 
 
 		 343 aa  288  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  73.44 
 
 		 767 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  64.59 
 
 		 428 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  67.49 
 
 		 1001 aa  275  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  71.12 
 
 		 338 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  67.17 
 
 		 494 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  68.75 
 
 		 692 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  55.32 
 
 		 411 aa  256  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  56.22 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  52.44 
 
 		 524 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  58.49 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  50.45 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  58.33 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  51.94 
 
 		 1160 aa  200  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  50.51 
 
 		 357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  48.72 
 
 		 683 aa  188  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  44.98 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  48.76 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  41.63 
 
 		 337 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  32.74 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  29.48 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>