More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2769 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  54.68 
 
 
762 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  53.52 
 
 
777 aa  647    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  55.85 
 
 
752 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  54.58 
 
 
792 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  53.04 
 
 
746 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  52.5 
 
 
785 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  53.44 
 
 
755 aa  697    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 
785 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  51.87 
 
 
757 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  51.57 
 
 
766 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  53.69 
 
 
733 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  50.73 
 
 
760 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  54.14 
 
 
745 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  55.2 
 
 
765 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  53.17 
 
 
750 aa  656    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
769 aa  672    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  54.47 
 
 
769 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  56.58 
 
 
745 aa  693    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 
749 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  53.56 
 
 
782 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  50.73 
 
 
760 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  50.52 
 
 
761 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  53.56 
 
 
782 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  53.75 
 
 
782 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
739 aa  1414    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  52.7 
 
 
737 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  52.37 
 
 
760 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  52.84 
 
 
768 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  52.7 
 
 
737 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  52.77 
 
 
795 aa  630  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  52.7 
 
 
737 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  49.07 
 
 
867 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  54.61 
 
 
764 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  51.31 
 
 
764 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  53.05 
 
 
737 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  54.34 
 
 
763 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.33 
 
 
758 aa  616  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  50.14 
 
 
754 aa  618  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  53.65 
 
 
764 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  48.45 
 
 
779 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  52.78 
 
 
737 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  52.32 
 
 
773 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  49.93 
 
 
761 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  54.25 
 
 
739 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  52.49 
 
 
785 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 
785 aa  594  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  50.32 
 
 
810 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
810 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  50.68 
 
 
751 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.23 
 
 
847 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  48.35 
 
 
752 aa  571  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
770 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  51.19 
 
 
850 aa  555  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  47.25 
 
 
868 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.7 
 
 
798 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  44.53 
 
 
819 aa  535  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
797 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
802 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
802 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.04 
 
 
794 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
743 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.84 
 
 
805 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
798 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  38.93 
 
 
815 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
798 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.7 
 
 
805 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.84 
 
 
805 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  39.84 
 
 
805 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  48.64 
 
 
792 aa  505  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.7 
 
 
805 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.84 
 
 
805 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  39.84 
 
 
805 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
806 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
836 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
803 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  44.15 
 
 
811 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  42.07 
 
 
837 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  44.15 
 
 
811 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
753 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.77 
 
 
797 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  38.93 
 
 
750 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.48 
 
 
826 aa  492  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  42.47 
 
 
817 aa  492  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
838 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
786 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  44.02 
 
 
793 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
885 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
837 aa  485  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  42.14 
 
 
794 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
818 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
799 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  37.91 
 
 
759 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
836 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  36.4 
 
 
839 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
840 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  41.15 
 
 
831 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  41.58 
 
 
792 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>