19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0089 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  72.66 
 
 		 284 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  39.41 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  37.72 
 
 		 312 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  39.26 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  35.42 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  34.62 
 
 		 292 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  36.76 
 
 		 293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  41.97 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  32.59 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  35.31 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  34.15 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  34.16 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  29.68 
 
 		 339 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  32.27 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  31.1 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  30.07 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  28.52 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>