178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2850 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  81.34 
 
 
138 aa  225  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  64.23 
 
 
137 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  63.5 
 
 
137 aa  184  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  63.5 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  61.31 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  60.58 
 
 
137 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  59.85 
 
 
137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  56.93 
 
 
137 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  59.42 
 
 
141 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  59.56 
 
 
139 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  59.12 
 
 
137 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  56.93 
 
 
163 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  59.85 
 
 
138 aa  164  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  57.66 
 
 
137 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  58.82 
 
 
140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  54.35 
 
 
142 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  58.82 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  56.2 
 
 
139 aa  157  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  56.3 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  56.93 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  53.28 
 
 
142 aa  153  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  53.28 
 
 
142 aa  153  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  54.01 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  54.74 
 
 
137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  56.06 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  53.73 
 
 
147 aa  150  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  52.55 
 
 
139 aa  149  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  52.94 
 
 
141 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  54.89 
 
 
137 aa  147  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  51.85 
 
 
144 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  51.82 
 
 
144 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  52.17 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  51.8 
 
 
143 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  50.36 
 
 
141 aa  144  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  53.24 
 
 
143 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  50.37 
 
 
138 aa  142  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  49.63 
 
 
140 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  52.52 
 
 
143 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  52.14 
 
 
143 aa  140  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  48.53 
 
 
137 aa  139  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  50.35 
 
 
146 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  51.05 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  46.56 
 
 
139 aa  136  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  49.65 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  47.76 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  47.01 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  47.37 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  47.76 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  47.37 
 
 
158 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  45.45 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  45.81 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  45.75 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  43.05 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  42.38 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  41.45 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  40.79 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  41.72 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  42.11 
 
 
153 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  48.87 
 
 
148 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  42.11 
 
 
153 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  42.48 
 
 
156 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  41.06 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  37.78 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  39.74 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  42.38 
 
 
158 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  42.28 
 
 
152 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  39.61 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  45.33 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  44.14 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  43.45 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  43.45 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  44.59 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  43.45 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  37.31 
 
 
135 aa  105  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  41.18 
 
 
154 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  42.57 
 
 
153 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  43.06 
 
 
160 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  41.06 
 
 
152 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  40.27 
 
 
155 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  40.26 
 
 
155 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  37.31 
 
 
135 aa  103  9e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  43.14 
 
 
165 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  44.22 
 
 
152 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  41.89 
 
 
149 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  41.22 
 
 
149 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  36 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  36 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  41.45 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  42.18 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  39.31 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>