77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2160 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  38.76 
 
 
175 aa  109  2e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  41.57 
 
 
181 aa  107  7e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  43.95 
 
 
178 aa  107  9e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  39.47 
 
 
176 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  41.33 
 
 
173 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  36.69 
 
 
187 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  33.53 
 
 
179 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  39.05 
 
 
177 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  38.82 
 
 
176 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  38.82 
 
 
176 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  35.71 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  33.1 
 
 
179 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  40.13 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  35.92 
 
 
183 aa  89  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  35.46 
 
 
176 aa  83.6  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  40.4 
 
 
158 aa  82.4  3e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  41.73 
 
 
157 aa  82.4  3e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  38.89 
 
 
161 aa  78.2  7e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  34.97 
 
 
168 aa  75.9  3e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  32 
 
 
184 aa  75.5  4e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  33.72 
 
 
174 aa  75.5  4e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  36.94 
 
 
185 aa  74.7  6e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  35.67 
 
 
157 aa  74.7  7e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  69.7  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  36.49 
 
 
157 aa  69.3  3e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  33.57 
 
 
138 aa  68.2  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  31.21 
 
 
176 aa  68.6  5e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  29.8 
 
 
183 aa  67.8  8e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  31.91 
 
 
176 aa  67  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.14 
 
 
168 aa  66.2  2e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  66.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  65.9  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  65.9  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  65.9  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  30.64 
 
 
164 aa  65.1  6e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  65.1  6e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  65.1  6e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  35.9 
 
 
195 aa  63.5  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  32.17 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  30.99 
 
 
140 aa  62.8  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  63.2  2e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  30.5 
 
 
176 aa  62.4  3e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  29.29 
 
 
177 aa  61.6  5e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  31.47 
 
 
138 aa  61.2  7e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  30.71 
 
 
136 aa  60.1  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  27.97 
 
 
177 aa  59.3  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  25.43 
 
 
177 aa  56.2  2e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  31.65 
 
 
144 aa  56.6  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  55.1  6e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  30.19 
 
 
167 aa  54.7  8e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  29.25 
 
 
147 aa  52.4  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  25.88 
 
 
162 aa  51.6  6e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  30.36 
 
 
178 aa  50.8  1e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  31.39 
 
 
177 aa  49.7  2e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  49.3  3e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  30.22 
 
 
177 aa  48.9  4e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  38.3 
 
 
143 aa  48.9  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  32.43 
 
 
145 aa  47.8  9e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  27.5 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  30.36 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  22.6 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.71 
 
 
145 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  26.49 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  28.69 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  28.69 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  28.69 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>