More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1389 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  296  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  57.86 
 
 		 146 aa  176  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  55.32 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  56.94 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  56.94 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  52.08 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  50.69 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  55.48 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  54.29 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  51.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  49.65 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  50.36 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  51.43 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  47.52 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  52.17 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  47.22 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  51.08 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  46.53 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  50 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2478  thioredoxin domain-containing protein  55.94 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2375  thioredoxin-related  54.74 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  48.92 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  48.2 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  49.28 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  44.44 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  46.83 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  43.66 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  46.1 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  51.37 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  44.09 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  44.09 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  43.17 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  48.28 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  42.65 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  42.31 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  47.62 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  37.96 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  37.96 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  37.96 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  37.68 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  37.23 
 
 		 170 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  41.54 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  37.96 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  37.96 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  44.06 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  41.84 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  40.29 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  37.69 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  36.5 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  40.56 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  38.46 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  38.46 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  38.46 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  37.06 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  39.29 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  40.48 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  39.86 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  33.85 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  42.86 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.48 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  41.27 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  41.27 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  41.27 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  41.27 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  41.27 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  37.96 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  38.97 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  33.09 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  34.31 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0306  thioredoxin  38.03 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00417001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  37.96 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  38.89 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  37.3 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  38.21 
 
 		 162 aa  105  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  32.35 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  34.53 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  36.59 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  36.55 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  37.96 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  38.46 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  42.64 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  35.94 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  42.37 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  36.73 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  36 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.22 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  41.84 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>