209 genes were found for organism Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dgeo_2905  CDS  NC_009939  161  487  327  addiction module antitoxin  YP_001527646  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2906  CDS  NC_009939  551  814  264  prevent-host-death family protein  YP_001527647  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2907  CDS  NC_009939  1206  1691  486  hypothetical protein  YP_001527648  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2908  CDS  NC_009939  1685  2302  618  hypothetical protein  YP_001527649  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2909  CDS  NC_009939  2313  3140  828  hypothetical protein  YP_001527650  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2910  CDS  NC_009939  3322  3849  528  transposase, IS4  YP_001527651  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2911  CDS  NC_009939  3863  4447  585  transposase IS4 family protein  YP_001527652  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2912  CDS  NC_009939  4580  5575  996  transposase IS4 family protein  YP_001527653  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2913  CDS  NC_009939  5697  6410  714  transposase  YP_001527654  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2914  CDS  NC_009939  6560  7471  912  hypothetical protein  YP_001527655  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2915  CDS  NC_009939  7818  8309  492  hypothetical protein  YP_001527656  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2916  CDS  NC_009939  8435  9853  1419  Alpha-amylase  YP_001527657  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2917  CDS  NC_009939  9856  10677  822  ABC-type sugar transport system, permease component  YP_001527658  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2918  CDS  NC_009939  10670  11587  918  ABC-type sugar transport system, permease component  YP_001527659  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2919  CDS  NC_009939  11596  12819  1224  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  YP_001527660  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2920  CDS  NC_009939  12833  13789  957  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_001527661  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2921  CDS  NC_009939  14406  15281  876  hypothetical protein  YP_001527662  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2922  CDS  NC_009939  15432  16373  942  threonine dehydratase  YP_001527663  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2923  CDS  NC_009939  16437  18164  1728  hypothetical protein  YP_001527664  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2924  CDS  NC_009939  18138  18617  480  ribonuclease H  YP_001527665  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2925  CDS  NC_009939  19113  20336  1224  divergent AAA-4 ATPase related protein  YP_001527666  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2926  CDS  NC_009939  20329  20814  486  hypothetical protein  YP_001527667  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2927  CDS  NC_009939  20817  20957  141  hypothetical protein  YP_001527668  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2928  CDS  NC_009939  21037  21324  288  hypothetical protein  YP_001527669  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2929  CDS  NC_009939  21333  21932  600  hypothetical protein  YP_001527670  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2930  CDS  NC_009939  21960  23237  1278  hypothetical protein  YP_001527671  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2931  CDS  NC_009939  23234  23998  765  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  YP_001527672  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2932  CDS  NC_009939  24158  25153  996  transposase IS4 family protein  YP_001527673  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2933  CDS  NC_009939  25690  27354  1665  hypothetical protein  YP_001527674  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2934  CDS  NC_009939  27362  27736  375  hypothetical protein  YP_001527675  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2935  CDS  NC_009939  27733  27993  261  IS1 related protein  YP_001527676  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2936  CDS  NC_009939  28035  28481  447  IS1 transposase  YP_001527677  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2937  CDS  NC_009939  28481  28789  309  hypothetical protein  YP_001527678  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2938  CDS  NC_009939  28809  30575  1767  Sir2-like deacetylase  YP_001527679  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2939  CDS  NC_009939  30872  31723  852  hypothetical protein  YP_001527680  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2940  CDS  NC_009939  32599  33105  507  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001527681  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2941  CDS  NC_009939  33102  33380  279  CopG family protein  YP_001527682  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2942  CDS  NC_009939  33579  34538  960  XerD-like integrase  YP_001527683  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2943  CDS  NC_009939  35121  35441  321  hypothetical protein  YP_001527684  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2944  CDS  NC_009939  35431  37719  2289  serine/threonine kinase protein  YP_001527685  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2945  CDS  NC_009939  37759  38472  714  transposase  YP_001527686  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2946  CDS  NC_009939  38596  39621  1026  hypothetical protein  YP_001527687  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2947  CDS  NC_009939  39726  40751  1026  hypothetical protein  YP_001527688  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2948  CDS  NC_009939  41088  43613  2526  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  YP_001527689  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2949  CDS  NC_009939  43625  44566  942  hypothetical protein  YP_001527690  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2950  CDS  NC_009939  44547  46667  2121  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_001527691  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2951  CDS  NC_009939  46747  49554  2808  ATPase involved in conjugal plasmid transfer TRAG  YP_001527692  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2952  CDS  NC_009939  49554  50090  537  hypothetical protein  YP_001527693  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2953  CDS  NC_009939  50138  51049  912  hypothetical protein  YP_001527694  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2954  CDS  NC_009939  51218  52354  1137  hypothetical protein  YP_001527695  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2955  CDS  NC_009939  52628  53149  522  hypothetical protein  YP_001527696  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2956  CDS  NC_009939  53230  55719  2490  hypothetical protein  YP_001527697  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2957  CDS  NC_009939  56296  56658  363  hypothetical protein  YP_001527698  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2958  CDS  NC_009939  56723  57100  378  hypothetical protein  YP_001527699  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2959  CDS  NC_009939  57400  58242  843  lytic transglycosylase catalytic  YP_001527700  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2960  CDS  NC_009939  58367  59335  969  AAA ATPase  YP_001527701  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2961  CDS  NC_009939  59390  60007  618  hypothetical protein  YP_001527702  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2962  CDS  NC_009939  60074  60406  333  hypothetical protein  YP_001527703  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2963  CDS  NC_009939  60394  61683  1290  hypothetical protein  YP_001527704  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2964  CDS  NC_009939  62369  63220  852  single-strand binding protein  YP_001527705  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2965  CDS  NC_009939  63726  64025  300  hypothetical protein  YP_001527706  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2966  CDS  NC_009939  64077  64919  843  hypothetical protein  YP_001527707  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2967  CDS  NC_009939  65217  66779  1563  UvrD/REP helicase  YP_001527708  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2968  CDS  NC_009939  66866  67447  582  hypothetical protein  YP_001527709  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2969  CDS  NC_009939  67535  68593  1059  single-strand binding protein  YP_001527710  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2970  CDS  NC_009939  68707  70293  1587  acyltransferase 3  YP_001527711  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2971  CDS  NC_009939  70412  70678  267  hypothetical protein  YP_001527712  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2972  CDS  NC_009939  70698  70919  222  hypothetical protein  YP_001527713  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2973  CDS  NC_009939  71495  71686  192  hypothetical protein  YP_001527714  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2974  CDS  NC_009939  71791  72393  603  RES domain-containing protein  YP_001527715  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2975  CDS  NC_009939  72434  72841  408  hypothetical protein  YP_001527716  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2976  CDS  NC_009939  72914  73096  183  hypothetical protein  YP_001527717  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2977  CDS  NC_009939  73199  73444  246  hypothetical protein  YP_001527718  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2978  CDS  NC_009939  73488  73811  324  hypothetical protein  YP_001527719  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2979  CDS  NC_009939  74073  74714  642  hypothetical protein  YP_001527720  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2980  CDS  NC_009939  74922  75839  918  ParB-like chromosome partitioning protein  YP_001527721  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2981  CDS  NC_009939  75836  76861  1026  PHD family antitoxin/ParA family chromosome partitioning ATPase  YP_001527722  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2982  CDS  NC_009939  77270  78187  918  DMT family permease  YP_001527723  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2983  CDS  NC_009939  78291  78533  243  hypothetical protein  YP_001527724  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2984  CDS  NC_009939  78816  79301  486  hypothetical protein  YP_001527725  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2985  CDS  NC_009939  79448  79939  492  hypothetical protein  YP_001527726  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2986  CDS  NC_009939  79964  80437  474  hypothetical protein  YP_001527727  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2987  CDS  NC_009939  80761  81207  447  IS1 transposase  YP_001527728  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2988    NC_009939  81491  82177  687      n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2989  CDS  NC_009939  82301  83296  996  transposase IS4 family protein  YP_001527729  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2990  CDS  NC_009939  83278  83433  156  IS1 related protein  YP_001527730  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2991  CDS  NC_009939  83430  83729  300  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001527731  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2992  CDS  NC_009939  84147  84629  483  hypothetical protein  YP_001527732  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2993  CDS  NC_009939  84644  85564  921  parB-like partition protein  YP_001527733  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2994  CDS  NC_009939  85628  86350  723  hypothetical protein  YP_001527734  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2995  CDS  NC_009939  86443  88173  1731  ATPase  YP_001527735  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2996  CDS  NC_009939  88262  89209  948  Zn-dependent peptidase  YP_001527736  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2997  CDS  NC_009939  89214  89927  714  transposase  YP_001527737  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2998    NC_009939  90190  90492  303      n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2999  CDS  NC_009939  90779  91153  375  hypothetical protein  YP_001527738  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_3000  CDS  NC_009939  91386  93113  1728  alkaline phosphatase  YP_001527739  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_3001  CDS  NC_009939  93167  93616  450  hypothetical protein  YP_001527740  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_3002  CDS  NC_009939  93881  94108  228  hypothetical protein  YP_001527741  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_3003  CDS  NC_009939  94101  94343  243  hypothetical protein  YP_001527742  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_3004  CDS  NC_009939  94343  95167  825  ApbE-like lipoprotein  YP_001527743  n/a    n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>