More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2993 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2993  parB-like partition protein  100 
 
 
306 aa  604  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  35.03 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  28 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  32.57 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.8 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  32.03 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  23.81 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  31.88 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  32.61 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  28 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  27.89 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  30.67 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  32.22 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  30.53 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  27.62 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  29.94 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  29.94 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  28.38 
 
 
392 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  29.56 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  27.04 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  27.91 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.29 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  34.03 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  31.25 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  30.25 
 
 
410 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  30.67 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  29.8 
 
 
574 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  27.85 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  29.37 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  32.61 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  32.12 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  31.82 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2980  ParB-like chromosome partitioning protein  29.41 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.1 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  29.33 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  26.76 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  28.99 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.88 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  35.83 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  35.83 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  23.46 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  31.03 
 
 
282 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  38 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 
289 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  27.59 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  26.17 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  29.17 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  29.37 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  30 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  33.79 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  33.79 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  30.99 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  30.99 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  26.97 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  32.17 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  33.79 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  29.29 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.93 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  36 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  29.86 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  29.17 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  28.87 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  26.11 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  31.03 
 
 
583 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  26.06 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.17 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  34.31 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.8 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  26.9 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  26.9 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.8 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  27.15 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  32.62 
 
 
668 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.47 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  31.78 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  28.47 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.47 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  26.79 
 
 
293 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  31.32 
 
 
605 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  29.37 
 
 
379 aa  56.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  27.15 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  34.68 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  29.2 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30.07 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  25.93 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  27.17 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.47 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  32.89 
 
 
624 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  28.47 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  28.47 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  25.37 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  29.53 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>