More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2987 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2377  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2446  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.994659  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2533  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2578  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2587  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.940725  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2595  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00695571  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2700  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2795  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0430  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.356637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0805  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1673  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2936  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2987  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3100  IS1 transposase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2436  IS1 transposase  99.32 
 
 
148 aa  297  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2372  IS1 transposase  93.92 
 
 
148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2383  IS1 transposase  93.92 
 
 
148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.597317  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2433  IS1 transposase  93.92 
 
 
148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0614  IS1 transposase  93.92 
 
 
148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261019  normal  0.286378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  35.94 
 
 
232 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0281  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4897  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4905  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2309  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01871  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000392392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01253  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02416  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02102  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01385  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  40.91 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  40.91 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00240  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.909946  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2054  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0909  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00244451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1319  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.808236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1981  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3916  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.753091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0964  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2814  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2683  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.393271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  40.3 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3362  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1626  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1722  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1976  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2010  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3942  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3597  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.169674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2090  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3236  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2649  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  40.3 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  40.3 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  40.3 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4874  IS1 transposase orfB  39.39 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  40.91 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00344  hypothetical protein  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00317  hypothetical protein  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00576  hypothetical protein  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00560  hypothetical protein  40.15 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1499  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4022  IS1 transposase orfB  37.41 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0009  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1729  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0802  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0706  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.60614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1065  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0818  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0101  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0333  IS1, transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0134876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0917  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1332  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00400739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1082  IS1 transposase orfB  40.15 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>