56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Tyr-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  90.28 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  91.94 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  85.54 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  84.34 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  84.34 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  89.8 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  89.36 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0013  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000015326  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0024  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  83.56 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  84.93 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  84.93 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0024  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0055  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000670702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0011  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000214053  hitchhiker  0.00323075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t09  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000014277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0004  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216119  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0016  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  83.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0019  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0050  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0039  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0018  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0060  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0059  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.686612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>