More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0035 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  91.86 
 
 		 86 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  91.86 
 
 		 86 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  91.86 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0018  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  96 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  95.83 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  95.83 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  95.83 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  95.83 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  95.65 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  95.65 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  95.45 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0049  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00226201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 81 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1892  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.729122  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 81 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1910  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178107  normal  0.179459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2336  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000102833  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1714  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0409502  normal  0.981337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1890  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710503  normal  0.374202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0056  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1716  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220424  normal  0.977011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0021  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1911  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0172015  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0058  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0020  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.230904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1884  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1446  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1947  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1886  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0997724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0006  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000863158  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1385  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1387  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1570  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1568  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2800  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1949  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4666  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000338441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t045  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0076  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0014  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0071  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0977282  normal  0.857098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>