250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0056 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  92.65 
 
 		 83 bp  95.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 83 bp  87.7  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0263  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 83 bp  87.7  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  88.16 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  89.83 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t045  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t047  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0013  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000242624  normal  0.0244003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0095  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000654361  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0096  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00070521  normal  0.980641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0097  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186117  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0013  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000911406  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0093  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00406786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0094  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000412805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0095  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000439573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0013  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000166479  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0092  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0093  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000411147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0094  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0011  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000044302  hitchhiker  0.000585411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0070  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157981  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0071  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0977282  normal  0.857098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0072  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0964412  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0013  tRNA-Tyr  85.53 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  84 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0009  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  88.14 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0013  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000015326  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  85.14 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0024  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  84.93 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.926918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>