60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2998 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2998  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  214  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2859  hypothetical protein  99.03 
 
 		 103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1222  hemimethylated DNA binding protein  32.58 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2926  hemimethylated DNA-binding region  34.12 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0868  hemimethylated DNA-binding region  38.82 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.540518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2230  hemimethylated DNA binding protein  33.33 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2048  hemimethylated DNA-binding region  31.73 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.257599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2944  hemimethylated DNA binding protein  33.33 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2615  hemimethylated DNA-binding region  32.69 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0856526  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2845  hemimethylated DNA-binding region  33.65 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2627  hemimethylated DNA-binding region  33.65 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255241  decreased coverage  0.0000297322 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0540  hemimethylated DNA-binding region  35.56 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2374  hypothetical protein  32.99 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5916  hypothetical protein  35.42 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3636  hemimethylated DNA binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2192  hemimethylated DNA binding protein  29 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.623314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0574  hypothetical protein  34.44 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2478  hemimethylated DNA-binding region protein  30.68 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1508  hemimethylated DNA-binding region  29.81 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0818  hemimethylated DNA binding protein  33.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3096  hemimethylated DNA binding protein  31.31 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59059  normal  0.175392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3890  hemimethylated DNA binding protein  36.9 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.886422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6314  hemimethylated DNA binding protein  35.35 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.627712  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1919  hemimethylated DNA binding protein  34.88 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4151  hypothetical protein  31.07 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1735  hemimethylated DNA binding protein  34.88 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0063  hemimethylated DNA-binding region  32.99 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0304812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1169  hemimethylated DNA binding protein  31.91 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959294  normal  0.390056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2209  hemimethylated DNA binding protein  34.12 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.034915  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1096  hemimethylated DNA-binding region  33.65 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0432  hemimethylated DNA-binding protein  33.72 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3869  hemimethylated DNA binding protein  30.69 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0148  hemimethylated DNA binding protein  32.14 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1498  hypothetical protein  32.14 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1655  hemimethylated DNA binding protein  31.13 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4391  hemimethylated DNA binding protein  31.19 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0778039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4286  hemimethylated DNA binding protein  30.28 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0614231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7179  hemimethylated DNA binding protein  30.61 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2903  hemimethylated DNA binding protein  30.95 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815336  normal  0.520638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3918  hemimethylated DNA binding protein  30.28 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.367378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1697  hemimethylated DNA binding protein  30.61 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0070  hemimethylated DNA binding protein  31 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2364  hemimethylated DNA-binding region  29.79 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.792723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1390  hemimethylated DNA binding protein  28.85 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340572  normal  0.9346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00970  DNA-binding protein, hemimethylated  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2677  hemimethylated DNA binding protein  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00977  hypothetical protein  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.638508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2152  heat shock protein HspQ  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174968  normal  0.392928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1075  heat shock protein HspQ  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000253842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1081  heat shock protein HspQ  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1131  heat shock protein HspQ  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.900818  normal  0.318941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2349  heat shock protein HspQ  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2630  heat shock protein HspQ  26.74 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15523  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0412  heat shock protein HspQ  29.07 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2689  heat shock protein HspQ  31.82 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1763  heat shock protein HspQ  30.43 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0679571  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1218  heat shock protein HspQ  27.91 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1478  heat shock protein HspQ  29.07 
 
 		 105 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2849  heat shock protein HspQ  29.49 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0501717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2540  heat shock protein HspQ  31.4 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0223653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>