48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5916 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5916  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3636  hemimethylated DNA binding protein  54.46 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3096  hemimethylated DNA binding protein  54.29 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59059  normal  0.175392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2615  hemimethylated DNA-binding region  54 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0856526  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2944  hemimethylated DNA binding protein  55 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0574  hypothetical protein  52.48 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2845  hemimethylated DNA-binding region  55 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2209  hemimethylated DNA binding protein  54.21 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.034915  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2627  hemimethylated DNA-binding region  55 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255241  decreased coverage  0.0000297322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3918  hemimethylated DNA binding protein  57.58 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.367378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1508  hemimethylated DNA-binding region  53 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4391  hemimethylated DNA binding protein  57.58 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0778039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4286  hemimethylated DNA binding protein  57.58 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0614231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1697  hemimethylated DNA binding protein  53.92 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0540  hemimethylated DNA-binding region  51.49 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0063  hemimethylated DNA-binding region  55.45 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0304812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1655  hemimethylated DNA binding protein  55.45 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2903  hemimethylated DNA binding protein  56.44 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815336  normal  0.520638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4151  hypothetical protein  50.96 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2230  hemimethylated DNA binding protein  52.88 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1498  hypothetical protein  54.46 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0148  hemimethylated DNA binding protein  54.46 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2048  hemimethylated DNA-binding region  52 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.257599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2364  hemimethylated DNA-binding region  56.25 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.792723  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0432  hemimethylated DNA-binding protein  52.48 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2192  hemimethylated DNA binding protein  49.52 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.623314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7179  hemimethylated DNA binding protein  55.45 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3890  hemimethylated DNA binding protein  57.58 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.886422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2374  hypothetical protein  49.53 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6314  hemimethylated DNA binding protein  54.46 
 
 		 115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.627712  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1390  hemimethylated DNA binding protein  50.5 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340572  normal  0.9346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0070  hemimethylated DNA binding protein  55.91 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1919  hemimethylated DNA binding protein  50 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1735  hemimethylated DNA binding protein  50 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0818  hemimethylated DNA binding protein  52.08 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1096  hemimethylated DNA-binding region  51 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2478  hemimethylated DNA-binding region protein  48.48 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3869  hemimethylated DNA binding protein  52.94 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1169  hemimethylated DNA binding protein  49.04 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959294  normal  0.390056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0868  hemimethylated DNA-binding region  38.68 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.540518  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2926  hemimethylated DNA-binding region  35.29 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1222  hemimethylated DNA binding protein  33.68 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2859  hypothetical protein  35.42 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2998  hypothetical protein  35.42 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1218  heat shock protein HspQ  32.22 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2540  heat shock protein HspQ  31.87 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0223653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2689  heat shock protein HspQ  30.77 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2849  heat shock protein HspQ  29.67 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0501717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>