55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0432 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0432  hemimethylated DNA-binding protein  100 
 
 
108 aa  225  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0148  hemimethylated DNA binding protein  76.85 
 
 
121 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1498  hypothetical protein  76.85 
 
 
121 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2903  hemimethylated DNA binding protein  75 
 
 
121 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815336  normal  0.520638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0070  hemimethylated DNA binding protein  75.93 
 
 
108 aa  179  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0063  hemimethylated DNA-binding region  74.07 
 
 
108 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0304812  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0818  hemimethylated DNA binding protein  67.96 
 
 
110 aa  163  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0574  hypothetical protein  64.36 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3636  hemimethylated DNA binding protein  63.37 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924166  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0540  hemimethylated DNA-binding region  63.37 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1697  hemimethylated DNA binding protein  64.58 
 
 
110 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3096  hemimethylated DNA binding protein  62.63 
 
 
110 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59059  normal  0.175392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2209  hemimethylated DNA binding protein  60.19 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.034915  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2230  hemimethylated DNA binding protein  59.6 
 
 
109 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2944  hemimethylated DNA binding protein  60 
 
 
110 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2478  hemimethylated DNA-binding region protein  58.1 
 
 
126 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7179  hemimethylated DNA binding protein  65.17 
 
 
157 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334825  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3918  hemimethylated DNA binding protein  58.59 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.367378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1390  hemimethylated DNA binding protein  58.42 
 
 
109 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340572  normal  0.9346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6314  hemimethylated DNA binding protein  65.17 
 
 
115 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.627712  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4151  hypothetical protein  62.5 
 
 
110 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864321  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4286  hemimethylated DNA binding protein  58.59 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0614231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4391  hemimethylated DNA binding protein  58.59 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0778039  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2364  hemimethylated DNA-binding region  58.42 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.792723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2845  hemimethylated DNA-binding region  60.78 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2627  hemimethylated DNA-binding region  60.78 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255241  decreased coverage  0.0000297322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2615  hemimethylated DNA-binding region  57.84 
 
 
110 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0856526  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2192  hemimethylated DNA binding protein  54.81 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.623314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2374  hypothetical protein  59.41 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1169  hemimethylated DNA binding protein  55.77 
 
 
111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959294  normal  0.390056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1508  hemimethylated DNA-binding region  58.33 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3890  hemimethylated DNA binding protein  55.45 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.886422  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2048  hemimethylated DNA-binding region  57.69 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.257599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1655  hemimethylated DNA binding protein  56.57 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1735  hemimethylated DNA binding protein  52.48 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1919  hemimethylated DNA binding protein  52.48 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1096  hemimethylated DNA-binding region  57 
 
 
124 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3869  hemimethylated DNA binding protein  51.46 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5916  hypothetical protein  52.48 
 
 
108 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2926  hemimethylated DNA-binding region  39.05 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0868  hemimethylated DNA-binding region  42.59 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.540518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1222  hemimethylated DNA binding protein  40.62 
 
 
106 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2859  hypothetical protein  33.72 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2998  hypothetical protein  33.72 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2540  heat shock protein HspQ  34.09 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0223653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1218  heat shock protein HspQ  31.58 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2849  heat shock protein HspQ  31.82 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0501717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2689  heat shock protein HspQ  33.71 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2621  heat shock protein HspQ  34.09 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3208  heat shock protein HspQ  34.09 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015468  normal  0.0185352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2532  heat shock protein HspQ  34.09 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09059  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
477 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.734832  hitchhiker  0.000000360431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1478  heat shock protein HspQ  32.95 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1763  heat shock protein HspQ  32.95 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0679571  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0412  heat shock protein HspQ  32.39 
 
 
105 aa  42  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>