20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5008 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  56.12 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  55.71 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  52.9 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  50.71 
 
 		 138 aa  153  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  45.76 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  46.9 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  37.08 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  43.02 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  34.11 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  37.21 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  37.21 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  36.67 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  36.76 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  28.35 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  36.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  37.21 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  33.72 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1215  hypothetical protein  36.23 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0858659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>