20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1801 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  292  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  74.13 
 
 
143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  48.25 
 
 
144 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  43.54 
 
 
149 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  45.64 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  45.79 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  40.8 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  43.8 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  49.5 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  41.38 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  37.21 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  41.38 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1215  hypothetical protein  32.23 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0858659  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  45.59 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  38.64 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  39.76 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  34.41 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  31.91 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>