13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1215 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1215  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0858659  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  45.22 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  38.21 
 
 
144 aa  84.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  40.17 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  42.17 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  29.82 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  33.61 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  32.23 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  37.35 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  42.86 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  36.23 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>