19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0420 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  45.64 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  45.83 
 
 
143 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  42.76 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  40.46 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  42.54 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  43.56 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  37.16 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  36.96 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1215  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0858659  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  45.35 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  41.86 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  39.08 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  33.72 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  33.72 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  30.84 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  45.21 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  35.56 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>