18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5801 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  77.63 
 
 
143 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  71.05 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  52.24 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  40.86 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  48.61 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  45.07 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  45.59 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  38.81 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  38.24 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  36.62 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  42.19 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  44.12 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  34.67 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  45.21 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1215  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0858659  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  36.92 
 
 
183 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>