18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6482 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  273  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  80.29 
 
 
137 aa  224  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  48.46 
 
 
139 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  46.51 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  46.9 
 
 
139 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  38.14 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  34.45 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  46.34 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  45.35 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  39.29 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  40.48 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  40.48 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  48.19 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  35.54 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  38.2 
 
 
148 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  39.76 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  33.58 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>