19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5129 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  292  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  52.9 
 
 
139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  45.99 
 
 
158 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  43.07 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  39.17 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  34.45 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  44.21 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  35.78 
 
 
187 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  43.33 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  38.3 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  40.86 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  36.05 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  30.71 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  33.72 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  31.4 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  29.87 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  31.4 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  31.91 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>