17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5551 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  357  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  45.57 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  46.34 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  43.21 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  43.06 
 
 
158 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  36.76 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  28.12 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  44.64 
 
 
149 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  35.44 
 
 
126 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  34.18 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  37.84 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  32.91 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  29.87 
 
 
141 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  47.27 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  34.41 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>