20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1599 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1599  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1801  hypothetical protein  74.13 
 
 
143 aa  230  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3751  hypothetical protein  50.79 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.1029  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5379  hypothetical protein  45.58 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0420  hypothetical protein  45.83 
 
 
155 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0496  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4512  hypothetical protein  48.44 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5329  hypothetical protein  55.45 
 
 
187 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5353  hypothetical protein  42.98 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.40891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2650  hypothetical protein  39.55 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1215  hypothetical protein  33.61 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0858659  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4992  hypothetical protein  43.01 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4380  hypothetical protein  45.05 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827611  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6482  hypothetical protein  48.19 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406839  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5008  hypothetical protein  37.21 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6195  hypothetical protein  41.76 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00218155  normal  0.0270393 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5801  hypothetical protein  45.59 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  hitchhiker  0.00974711 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4744  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5551  hypothetical protein  39.77 
 
 
183 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5129  hypothetical protein  31.4 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>