284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3589 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4995  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3589  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303054  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  29.09 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  29.09 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  29.09 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2062  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4834  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4917  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.372028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0872  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000776676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4146  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4257  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0837855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  29.66 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  29.61 
 
 
168 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.62 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  30 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  30.99 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  30.99 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.65 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  29.41 
 
 
345 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  27.82 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2701  putative transposase  27.55 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  25.73 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.73 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  25.73 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  25.73 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  25.73 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  29.32 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  29.32 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  29.32 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0241  transposase  27.84 
 
 
189 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000404674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  47.06 
 
 
79 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  28.05 
 
 
356 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  28.05 
 
 
356 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  28.05 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  22.94 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  22.94 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  22.94 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  27.65 
 
 
343 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  27.84 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  26.83 
 
 
356 aa  55.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  29.48 
 
 
173 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0713  hypothetical protein  26.23 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2017  hypothetical protein  26.23 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.943461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1977  hypothetical protein  26.23 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  27.27 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  26.32 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  29.08 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1492  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024627  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0348  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00547365  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1463  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0463  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1378  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1621  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1617  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207058  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0277  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0683  transposase  27.61 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>