More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1977 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0713  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  683    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2017  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  683    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.943461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1977  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  683    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2014  hypothetical protein  98.19 
 
 
331 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0567677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3798  hypothetical protein  49.69 
 
 
327 aa  315  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2243  hypothetical protein  76.92 
 
 
127 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  26.99 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  26.99 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  26.99 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.99 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  26.99 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  26.28 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  26.28 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  26.28 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2449  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0463  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2860  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0802  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0277  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1617  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207058  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0808  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0348  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00547365  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0926  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0917  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1059  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1064  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0456  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1463  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1478  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1492  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024627  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0748  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1378  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2037  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1621  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1633  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.889999  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0683  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1425  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1912  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1737  transposase  36.16 
 
 
188 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00237927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0394  transposase  36.16 
 
 
188 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.238933  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07122  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06376  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05660  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02134  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01880  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05300  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01719  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.16 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02701  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4601  hypothetical protein  39 
 
 
103 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805525  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02688  hypothetical protein  28.62 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2479  resolvase helix-turn-helix domain protein  28 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.883551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05606  hypothetical protein  27.99 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05065  hypothetical protein  28.48 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  27.34 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04930  hypothetical protein  32.64 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06351  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05544  hypothetical protein  32.64 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06313  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02026  hypothetical protein  32.64 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02175  hypothetical protein  32.64 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05076  hypothetical protein  32.64 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08277  transposase  32.64 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01716  hypothetical protein  31.93 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06000  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06090  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06524  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04868  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05083  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07062  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06948  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05604  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05645  hypothetical protein  31.93 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05695  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06677  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02698  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2062  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0872  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000776676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4257  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0837855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4834  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4146  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4917  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.372028 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05079  hypothetical protein  27.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01304  hypothetical protein  26.54 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3598  hypothetical protein  21.08 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2467  transposase  32.26 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01714  hypothetical protein  31.28 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.87 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02155  hypothetical protein  31.56 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1308  transposase  39.09 
 
 
117 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.426794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01662  hypothetical protein  31.58 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  25 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  25 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>