More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4601 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4601  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  215  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805525  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3798  hypothetical protein  45.45 
 
 
327 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0713  hypothetical protein  39 
 
 
331 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2017  hypothetical protein  39 
 
 
331 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.943461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1977  hypothetical protein  39 
 
 
331 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2014  hypothetical protein  37 
 
 
331 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0567677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  38.54 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  38.54 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  38.54 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0808  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1617  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207058  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0683  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0348  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00547365  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0277  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0463  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1737  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00237927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1633  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.889999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2037  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1492  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1425  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0456  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62675  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1059  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1064  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0802  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0926  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1378  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1463  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2860  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2449  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0917  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1912  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1478  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0748  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1621  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0394  transposase  36.73 
 
 
188 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.238933  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1283  hypothetical protein  31.73 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0782139  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2298  hypothetical protein  31.73 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2854  hypothetical protein  31.73 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247659  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3055  hypothetical protein  31.73 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0585926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  31.96 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  31.96 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  32.06 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  31.96 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  31.96 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  31.25 
 
 
344 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  29.81 
 
 
348 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1308  transposase  44.83 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.426794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5260  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0107743  normal  0.171709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5113  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.493928 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5178  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1766  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  29.13 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  29.13 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  29.13 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  32.61 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0590  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.323741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0633  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000452222  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  30.93 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3020  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.489046  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1183  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  29.25 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5874  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00111277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3300  transposase  31.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  29.25 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.37 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  34 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  32.26 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0658  IS630 family transposase  32.99 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2873  IS630 family transposase  32.99 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2467  transposase  30.93 
 
 
190 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0049  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.155938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0325  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0702  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0860  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.661529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0876  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0958  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.569395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1289  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1794  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.401882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2052  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3025  IS630 family transposase  32.99 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.05528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  30.93 
 
 
188 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.96 
 
 
318 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  26.53 
 
 
332 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.53 
 
 
332 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  26.53 
 
 
332 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  26.53 
 
 
332 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  26.53 
 
 
332 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2869  hypothetical protein  30.43 
 
 
351 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1412  hypothetical protein  29.47 
 
 
342 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1933  hypothetical protein  29.47 
 
 
342 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>