42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0519 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0519  malonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
456 aa  922    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.819349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6289  putative malonyl-CoA decarboxylase (MCD)  60.05 
 
 
449 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0536  malonyl-CoA decarboxylase  59.02 
 
 
456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.518554  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5137  malonyl-CoA decarboxylase  57.71 
 
 
479 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.964153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0562  Malonyl-CoA decarboxylase  57.53 
 
 
473 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1479  malonyl-CoA decarboxylase  58.75 
 
 
469 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0704  malonyl-CoA decarboxylase  57.4 
 
 
473 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0148  malonyl-CoA decarboxylase  57.85 
 
 
472 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7252  Malonyl-CoA decarboxylase  58.41 
 
 
469 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0573  Malonyl-CoA decarboxylase  56.49 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6033  malonyl-CoA decarboxylase  58.41 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394395  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0615  Malonyl-CoA decarboxylase  55.46 
 
 
474 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5372  malonyl-CoA decarboxylase  55.45 
 
 
465 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5195  Malonyl-CoA decarboxylase  56.1 
 
 
469 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5267  Malonyl-CoA decarboxylase  55.43 
 
 
469 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4728  malonyl-CoA decarboxylase  56.32 
 
 
469 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.957227  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1720  malonyl-CoA decarboxylase  58.33 
 
 
456 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3835  malonyl-CoA decarboxylase  46.91 
 
 
415 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.14175 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3567  hypothetical protein  50.57 
 
 
435 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1683  malonyl-CoA decarboxylase  47.37 
 
 
503 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.512817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1228  Malonyl-CoA decarboxylase  43.78 
 
 
430 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3000  malonyl-CoA decarboxylase  45.27 
 
 
417 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0627  malonyl-CoA decarboxylase  42.89 
 
 
434 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2536  Malonyl-CoA decarboxylase  46.47 
 
 
494 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2754  malonyl-CoA decarboxylase  46.06 
 
 
501 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0993  Malonyl-CoA decarboxylase  42.44 
 
 
488 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1077  malonyl-CoA decarboxylase  42.44 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2785  malonyl-CoA decarboxylase  43.42 
 
 
475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.588447  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1511  malonyl-CoA decarboxylase  44.5 
 
 
497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.868951  normal  0.175031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1548  malonyl-CoA decarboxylase  44.04 
 
 
478 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.608534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1774  malonyl-CoA decarboxylase  44.17 
 
 
442 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710692  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2091  malonyl-CoA decarboxylase  44.12 
 
 
525 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191721  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2764  malonyl-CoA decarboxylase  41.2 
 
 
481 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355658  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2049  malonyl-CoA decarboxylase  43.1 
 
 
481 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3511  Malonyl-CoA decarboxylase  42.15 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.834521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2873  malonyl-CoA decarboxylase  40.18 
 
 
495 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.490404 
 
 
-
 
NC_002978  WD0478  malonyl-CoA decarboxylase, putative  35.68 
 
 
464 aa  279  7e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.376381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2797  malonyl-CoA decarboxylase  42.94 
 
 
473 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.64066  normal  0.351538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0645  malonyl-CoA decarboxylase  44.38 
 
 
480 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0267  malonyl-CoA decarboxylase  37.53 
 
 
458 aa  248  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.779803  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0814  putative malonyl-CoA decarboxylase  36.6 
 
 
457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10799  malonyl-coa decarboxylase  37.38 
 
 
326 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>