42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2049 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2754  malonyl-CoA decarboxylase  68.98 
 
 		 501 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1077  malonyl-CoA decarboxylase  68.18 
 
 		 486 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2049  malonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 481 aa  980    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2536  Malonyl-CoA decarboxylase  68.6 
 
 		 494 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0993  Malonyl-CoA decarboxylase  69.98 
 
 		 488 aa  631  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2091  malonyl-CoA decarboxylase  69.3 
 
 		 525 aa  630  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191721  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1511  malonyl-CoA decarboxylase  67.72 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.868951  normal  0.175031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2873  malonyl-CoA decarboxylase  64.07 
 
 		 495 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.490404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2764  malonyl-CoA decarboxylase  59.49 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1774  malonyl-CoA decarboxylase  46.7 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3511  Malonyl-CoA decarboxylase  47.79 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.834521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1548  malonyl-CoA decarboxylase  45.22 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.608534  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0645  malonyl-CoA decarboxylase  44.82 
 
 		 480 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0478  malonyl-CoA decarboxylase, putative  40.49 
 
 		 464 aa  319  9e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.376381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2797  malonyl-CoA decarboxylase  44.49 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.64066  normal  0.351538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1720  malonyl-CoA decarboxylase  45.45 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0704  malonyl-CoA decarboxylase  42.26 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0519  malonyl-CoA decarboxylase  43.86 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.819349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6289  putative malonyl-CoA decarboxylase (MCD)  42.69 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0536  malonyl-CoA decarboxylase  40.66 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.518554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0562  Malonyl-CoA decarboxylase  41.23 
 
 		 473 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7252  Malonyl-CoA decarboxylase  40.53 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0148  malonyl-CoA decarboxylase  41.57 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0627  malonyl-CoA decarboxylase  40.25 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6033  malonyl-CoA decarboxylase  41.63 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394395  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1228  Malonyl-CoA decarboxylase  41.82 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4728  malonyl-CoA decarboxylase  41.85 
 
 		 469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.957227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5195  Malonyl-CoA decarboxylase  41.85 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5267  Malonyl-CoA decarboxylase  41.58 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5137  malonyl-CoA decarboxylase  41.55 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.964153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0573  Malonyl-CoA decarboxylase  41.41 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0814  putative malonyl-CoA decarboxylase  39.52 
 
 		 457 aa  279  9e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0267  malonyl-CoA decarboxylase  36.78 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.779803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0615  Malonyl-CoA decarboxylase  43.94 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1683  malonyl-CoA decarboxylase  42.41 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.512817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1479  malonyl-CoA decarboxylase  41.23 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5372  malonyl-CoA decarboxylase  40.58 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3835  malonyl-CoA decarboxylase  39.42 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.14175 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3567  hypothetical protein  39.73 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2785  malonyl-CoA decarboxylase  41.05 
 
 		 475 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.588447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3000  malonyl-CoA decarboxylase  35.79 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10799  malonyl-coa decarboxylase  36.45 
 
 		 326 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>