42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1548 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1548  malonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 478 aa  961    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.608534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3511  Malonyl-CoA decarboxylase  50.23 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.834521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1774  malonyl-CoA decarboxylase  51.16 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0478  malonyl-CoA decarboxylase, putative  45.62 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.376381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1511  malonyl-CoA decarboxylase  46.65 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.868951  normal  0.175031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1077  malonyl-CoA decarboxylase  48.08 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0993  Malonyl-CoA decarboxylase  47.84 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2091  malonyl-CoA decarboxylase  46.05 
 
 		 525 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191721  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0267  malonyl-CoA decarboxylase  43.38 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.779803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2536  Malonyl-CoA decarboxylase  45.17 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0814  putative malonyl-CoA decarboxylase  41.53 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2873  malonyl-CoA decarboxylase  45.58 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.490404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2754  malonyl-CoA decarboxylase  44.27 
 
 		 501 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2049  malonyl-CoA decarboxylase  45.14 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0562  Malonyl-CoA decarboxylase  43.66 
 
 		 473 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6289  putative malonyl-CoA decarboxylase (MCD)  43.37 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2764  malonyl-CoA decarboxylase  46.45 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1683  malonyl-CoA decarboxylase  44.04 
 
 		 503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.512817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1720  malonyl-CoA decarboxylase  43.98 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0704  malonyl-CoA decarboxylase  43.39 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0519  malonyl-CoA decarboxylase  44.04 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.819349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0148  malonyl-CoA decarboxylase  41.96 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0536  malonyl-CoA decarboxylase  41.67 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.518554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5372  malonyl-CoA decarboxylase  41.26 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0573  Malonyl-CoA decarboxylase  41.07 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2797  malonyl-CoA decarboxylase  41.37 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.64066  normal  0.351538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0627  malonyl-CoA decarboxylase  43.07 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0615  Malonyl-CoA decarboxylase  41.53 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2785  malonyl-CoA decarboxylase  43.26 
 
 		 475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.588447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0645  malonyl-CoA decarboxylase  43.26 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1228  Malonyl-CoA decarboxylase  41.65 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4728  malonyl-CoA decarboxylase  43.91 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.957227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5267  Malonyl-CoA decarboxylase  43.94 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5195  Malonyl-CoA decarboxylase  43.44 
 
 		 469 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7252  Malonyl-CoA decarboxylase  42.24 
 
 		 469 aa  269  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1479  malonyl-CoA decarboxylase  43 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5137  malonyl-CoA decarboxylase  40.09 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.964153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6033  malonyl-CoA decarboxylase  40.77 
 
 		 469 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394395  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3567  hypothetical protein  41.63 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3835  malonyl-CoA decarboxylase  42.33 
 
 		 415 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.14175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3000  malonyl-CoA decarboxylase  39.04 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10799  malonyl-coa decarboxylase  36.31 
 
 		 326 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>