42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0615 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0615  Malonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 
474 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5372  malonyl-CoA decarboxylase  74.6 
 
 
465 aa  681    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0573  Malonyl-CoA decarboxylase  90.08 
 
 
474 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5137  malonyl-CoA decarboxylase  63.64 
 
 
479 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.964153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0562  Malonyl-CoA decarboxylase  57.79 
 
 
473 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7252  Malonyl-CoA decarboxylase  56.89 
 
 
469 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5195  Malonyl-CoA decarboxylase  56.36 
 
 
469 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6033  malonyl-CoA decarboxylase  56.46 
 
 
469 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394395  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1479  malonyl-CoA decarboxylase  57.43 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4728  malonyl-CoA decarboxylase  56.36 
 
 
469 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.957227  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5267  Malonyl-CoA decarboxylase  55.26 
 
 
469 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0148  malonyl-CoA decarboxylase  57.6 
 
 
472 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0519  malonyl-CoA decarboxylase  55.46 
 
 
456 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.819349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0704  malonyl-CoA decarboxylase  56.59 
 
 
473 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6289  putative malonyl-CoA decarboxylase (MCD)  56.63 
 
 
449 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0536  malonyl-CoA decarboxylase  52.52 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.518554  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1720  malonyl-CoA decarboxylase  57.84 
 
 
456 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3835  malonyl-CoA decarboxylase  45.77 
 
 
415 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.14175 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3567  hypothetical protein  48.87 
 
 
435 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3000  malonyl-CoA decarboxylase  49.26 
 
 
417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1683  malonyl-CoA decarboxylase  46.82 
 
 
503 aa  346  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.512817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0627  malonyl-CoA decarboxylase  45.48 
 
 
434 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138048  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1228  Malonyl-CoA decarboxylase  43.28 
 
 
430 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2754  malonyl-CoA decarboxylase  43.64 
 
 
501 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2785  malonyl-CoA decarboxylase  41.61 
 
 
475 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.588447  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2536  Malonyl-CoA decarboxylase  43.07 
 
 
494 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1774  malonyl-CoA decarboxylase  43.89 
 
 
442 aa  296  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3511  Malonyl-CoA decarboxylase  41.96 
 
 
460 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.834521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1077  malonyl-CoA decarboxylase  43.72 
 
 
486 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0993  Malonyl-CoA decarboxylase  43.72 
 
 
488 aa  286  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2764  malonyl-CoA decarboxylase  41.23 
 
 
481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355658  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1548  malonyl-CoA decarboxylase  41.53 
 
 
478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.608534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2091  malonyl-CoA decarboxylase  42.37 
 
 
525 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191721  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1511  malonyl-CoA decarboxylase  41.79 
 
 
497 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.868951  normal  0.175031 
 
 
-
 
NC_002978  WD0478  malonyl-CoA decarboxylase, putative  35.4 
 
 
464 aa  277  4e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.376381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2873  malonyl-CoA decarboxylase  42.56 
 
 
495 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.490404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2049  malonyl-CoA decarboxylase  43.94 
 
 
481 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0645  malonyl-CoA decarboxylase  42.08 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2797  malonyl-CoA decarboxylase  45.31 
 
 
473 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.64066  normal  0.351538 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0267  malonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 
458 aa  246  6.999999999999999e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.779803  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0814  putative malonyl-CoA decarboxylase  37.31 
 
 
457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10799  malonyl-coa decarboxylase  35.09 
 
 
326 aa  170  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>