42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2873 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0993  Malonyl-CoA decarboxylase  66.4 
 
 		 488 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1077  malonyl-CoA decarboxylase  66.6 
 
 		 486 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2873  malonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 495 aa  996    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.490404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2091  malonyl-CoA decarboxylase  70.1 
 
 		 525 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191721  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1511  malonyl-CoA decarboxylase  65.79 
 
 		 497 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.868951  normal  0.175031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2754  malonyl-CoA decarboxylase  63.64 
 
 		 501 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2536  Malonyl-CoA decarboxylase  67.64 
 
 		 494 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2049  malonyl-CoA decarboxylase  66.67 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2764  malonyl-CoA decarboxylase  58.94 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1774  malonyl-CoA decarboxylase  47.2 
 
 		 442 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3511  Malonyl-CoA decarboxylase  48.71 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.834521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0645  malonyl-CoA decarboxylase  45.52 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2797  malonyl-CoA decarboxylase  45.1 
 
 		 473 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.64066  normal  0.351538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1548  malonyl-CoA decarboxylase  45.58 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.608534  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0478  malonyl-CoA decarboxylase, putative  47.13 
 
 		 464 aa  293  4e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.376381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0536  malonyl-CoA decarboxylase  41.15 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.518554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0562  Malonyl-CoA decarboxylase  47.11 
 
 		 473 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749969  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0814  putative malonyl-CoA decarboxylase  39.9 
 
 		 457 aa  283  7.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0267  malonyl-CoA decarboxylase  40.4 
 
 		 458 aa  282  9e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.779803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0519  malonyl-CoA decarboxylase  40.18 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.819349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0573  Malonyl-CoA decarboxylase  39.43 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1683  malonyl-CoA decarboxylase  45.18 
 
 		 503 aa  279  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.512817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6289  putative malonyl-CoA decarboxylase (MCD)  40.14 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0627  malonyl-CoA decarboxylase  42.82 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1720  malonyl-CoA decarboxylase  40.53 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0148  malonyl-CoA decarboxylase  45.43 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5195  Malonyl-CoA decarboxylase  41.44 
 
 		 469 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4728  malonyl-CoA decarboxylase  41.44 
 
 		 469 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.957227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7252  Malonyl-CoA decarboxylase  41.58 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0615  Malonyl-CoA decarboxylase  42.56 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0704  malonyl-CoA decarboxylase  41.42 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1228  Malonyl-CoA decarboxylase  38.39 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5267  Malonyl-CoA decarboxylase  41.09 
 
 		 469 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6033  malonyl-CoA decarboxylase  40.04 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394395  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5372  malonyl-CoA decarboxylase  43.44 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3835  malonyl-CoA decarboxylase  39.76 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.14175 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5137  malonyl-CoA decarboxylase  41.03 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.964153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1479  malonyl-CoA decarboxylase  40.66 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199042 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3567  hypothetical protein  39.31 
 
 		 435 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2785  malonyl-CoA decarboxylase  38.85 
 
 		 475 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.588447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3000  malonyl-CoA decarboxylase  38.73 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10799  malonyl-coa decarboxylase  37.81 
 
 		 326 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>