42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0148 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0562  Malonyl-CoA decarboxylase  77.71 
 
 		 473 aa  733    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0704  malonyl-CoA decarboxylase  87.42 
 
 		 473 aa  823    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0148  malonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 472 aa  953    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1720  malonyl-CoA decarboxylase  64.24 
 
 		 456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0519  malonyl-CoA decarboxylase  57.85 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.819349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5137  malonyl-CoA decarboxylase  56.98 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.964153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0615  Malonyl-CoA decarboxylase  57.6 
 
 		 474 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5195  Malonyl-CoA decarboxylase  56.92 
 
 		 469 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7252  Malonyl-CoA decarboxylase  56.39 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4728  malonyl-CoA decarboxylase  56.48 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.957227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6033  malonyl-CoA decarboxylase  56.29 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394395  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5267  Malonyl-CoA decarboxylase  55.16 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0536  malonyl-CoA decarboxylase  55.11 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.518554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6289  putative malonyl-CoA decarboxylase (MCD)  55.43 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0573  Malonyl-CoA decarboxylase  54.89 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5372  malonyl-CoA decarboxylase  54.65 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1479  malonyl-CoA decarboxylase  55.7 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3835  malonyl-CoA decarboxylase  46.5 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.14175 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3567  hypothetical protein  51.36 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1683  malonyl-CoA decarboxylase  45.53 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.512817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3000  malonyl-CoA decarboxylase  48.48 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0627  malonyl-CoA decarboxylase  45.54 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2785  malonyl-CoA decarboxylase  46 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.588447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1228  Malonyl-CoA decarboxylase  44.94 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2536  Malonyl-CoA decarboxylase  43.33 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1774  malonyl-CoA decarboxylase  42.86 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1548  malonyl-CoA decarboxylase  41.96 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.608534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3511  Malonyl-CoA decarboxylase  41.58 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.834521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0993  Malonyl-CoA decarboxylase  40.37 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1077  malonyl-CoA decarboxylase  40.37 
 
 		 486 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2091  malonyl-CoA decarboxylase  39.91 
 
 		 525 aa  292  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191721  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2754  malonyl-CoA decarboxylase  41.15 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1511  malonyl-CoA decarboxylase  41.9 
 
 		 497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.868951  normal  0.175031 
 
 
-
 
NC_002978  WD0478  malonyl-CoA decarboxylase, putative  34.62 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.376381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2049  malonyl-CoA decarboxylase  41.09 
 
 		 481 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2873  malonyl-CoA decarboxylase  45.43 
 
 		 495 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.490404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2764  malonyl-CoA decarboxylase  40.14 
 
 		 481 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0645  malonyl-CoA decarboxylase  42.82 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2797  malonyl-CoA decarboxylase  42.86 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.64066  normal  0.351538 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0267  malonyl-CoA decarboxylase  36.36 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.779803  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0814  putative malonyl-CoA decarboxylase  36.3 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10799  malonyl-coa decarboxylase  36.63 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>